Принцип работы оптической светодиодной мыши: под корпусом с помощью светодиода подсвечивается поверхность, отраженный от нее свет попадает на принимающий сенсор микросхемы, а процессор фотографирует поверхность с высокой частотой, обрабатывает последовательные снимки и анализирует их, что позволяет вычислить направление и скорость движения курсора.

В оптической лазерной мыши поверхность подсвечивается лазером, который испускает узконаправленный пучок света, благодаря чему получаемые снимки более контрастны и позиционирование курсора достигает высокой точности.

Гироскопическая мышь работает на двуосном гироскопическом датчике, который считывает данные о ее положении в пространстве. Для работы с этой мышью поверхность не нужна, ее можно перемещать в воздухе. Курсор мыши может использоваться в качестве указки.